Morgan si laureò in ingegneria civile a Berkeley e fu poi la prima donna ammessa alla sezione di architettura dell'École des Beaux-Arts di Parigi e la prima a uscirne con un certificato, nel 1902. Due anni dopo era la prima donna abilitata all'esercizio della professione in California. La formazione da ingegnere ne decise il materiale: costruì in cemento armato quando in California non lo faceva quasi nessuno, e quando nel 1906 i contemporanei persero gli edifici in muratura non armata i suoi rimasero in piedi. In circa quarantacinque anni firmò quasi settecento opere — sedi della YWCA, circoli femminili, chiese, scuole, case e la lunga campagna di San Simeon per William Randolph Hearst. Non ebbe ufficio stampa, non concesse interviste e distrusse i propri disegni al momento del ritiro. L'AIA le assegnò la Medaglia d'Oro nel 2014, prima donna a riceverla, cinquantasette anni dopo la morte.
