Giovanni Battista Cairati, noto al servizio portoghese come João Baptista Cairato, nacque a Cairate, in Lombardia, e imparò il mestiere fortificando Malta e la Sardegna per i Cavalieri Ospitalieri, prima di dirigere le opere difensive di Milano negli anni Sessanta del Cinquecento. Entrò al servizio di Filippo II nel 1577 e nel 1583 fu nominato ingegnere capo dell'Estado da Índia, con l'incarico di rifare le fortezze portoghesi dell'oceano Indiano secondo la geometria a bastioni angolari della trace italienne. Per un decennio lavorò fra Vasai, Daman, Hormuz, Mascate, Mannar e Malacca. Verso il 1593 scelse il sito e tracciò la pianta del Forte Gesù di Mombasa, la sua ultima opera nota; morì a Goa nel 1596, probabilmente senza vederla compiuta, e gli successe Julio Simão.